自闭症可以由心理因素导致，心理认知缺陷会损害孤独症患者对其他人精神状态的理解能力，从而导致患者社会交往能力的缺乏，经常误解别人的行为。
小儿自闭症还有多种病因，研究表明，孤独症一般与某些疾病同时存在，比如结节性硬化和肌营养不良以及先天性风疹等等，所以有人认为孤独症本质上是一个多种病因的神经综合征。
治疗原则与用药治疗：小儿自闭症要综合治疗，最重要的步骤就是行为治疗和教育，这两者都是为了通过对患者进行正常行为的教育，达到矫正其社会性行为的目的，纠正患者们的异常行为，帮助消除他们的睡眠障碍，改善他们乱发脾气以及好动等等继发性症状。药物治疗不具有普遍性，只对个别症状有微小作用，比如如果是短期严重失眠，可以用安定，可用奋乃静治疗攻击性患者，用脑复新来促进脑功能改善，用利他林来治疗孤独和语言障碍。
注意事项：小儿自闭症是可以治好的，这一点毋庸置疑。有实验实例证明，如果治疗方法得当，小儿自闭患者的病情会得到有效控制并且好转。良好的治疗方法除了一些正常的交流治疗之外，还包括社会技能发展以及感官损害治疗等。专家们认为，通常情况下病情越重治疗效果越好，并且倡导一对一治疗。自闭症的治疗不仅需家长医生的帮助，而且需要整个社会的支持。
