儿童抑郁症治疗讲究全病程治疗原则。它分为急性期治疗、巩固期治疗和维持期治疗。急性期治疗一般8-12周，是为了尽快达到临床治愈与促进功能恢复，达到病前功能水平，提高患者生活质量。巩固期治疗一般4-9个月，在这个期间病情不稳定，复燃性比较大，主要以强调治疗方案，药物剂量，使用方法，保持急性期不变的这样一个特点。对于维持期治疗目前的研究时间并不充分，一般倾向于至少2-3年，多次复发的也就是三次及以上以及有明显残留症状的，主张长期服药治疗。
对于儿童抑郁症的治疗在临床上，它与一般的常规治疗原则并不完全一致。目前临床实践当中，坚持抗抑郁药和心理治疗并重的原则。心理治疗适合不同严重程度的儿童青少年抑郁症的患者，它主要有助于改变认知，完善人格，增强应对困难和挫折的能力，最终达到改善抑郁症状，减少功能损害作用。对于轻症抑郁症患者，如果说6-12周心理治疗抑郁症状无改善，常常提示需要合并抗抑郁药物治疗，而目前还没有一种抗抑郁药对儿童青少年是绝对安全的。但是目前临床上以5羟色胺摄取抑制剂作为儿童青少年抑郁障碍或抑郁症治疗的首选药物，如氟西汀，舍曲林，艾司西酞普兰作为一线用药，用药过程中小剂量开始缓慢加至有效剂量，足量足疗程系统治疗。因此儿童抑郁症的治疗，根据不同阶段，根据儿童个性化的特征，其治愈时间仍然有不同。
