阴茎根部囊肿可能是毛囊炎、皮脂腺囊肿、淋巴结炎、生殖器疱疹、尖锐湿疣等疾病导致，建议及时进行治疗。
1、毛囊炎：
当患者不注意局部卫生导致细菌侵入后容易对毛囊造成损伤，使患者出现以毛囊为中心的红色丘疹，还会伴有疼痛，可以在医生指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊、阿奇霉素分散片等药物治疗。
2、皮脂腺囊肿：
可能是毛囊皮脂腺口堵塞，皮脂聚集形成囊肿，如果囊肿比较大，则需要在医生操作下通过外科手术治疗。
3、淋巴结炎：
由于淋巴结遍布在全身，当病菌侵入人体后可能会使淋巴结局部感染，引起局部囊肿，可以在医生指导下服用头孢氨苄胶囊、罗红霉素胶囊、青霉素V钾片等药物治疗。
4、生殖器疱疹：
主要是单纯疱疹病毒感染引起，当病原菌侵入人体后会在皮肤的细胞内复制，引起局部炎症和坏死，在生殖器周围出现水疱、疼痛、溃疡等，可遵医嘱服用阿昔洛韦片、利巴韦林颗粒、盐酸伐昔洛韦片等药物治疗。
5、尖锐湿疣：
主要是人乳头瘤病毒侵入体内引起，会导致肛门和外生殖器皮肤黏膜出现赘生物，形态可为乳头状、菜花状等，可以在医生指导下通过鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏等药物治疗。
在日常生活中应保持平和的心态，积极配合医生进行治疗，还应保持局部的清洁和干燥。
