儿童艾滋病会出现肝,脾,淋巴结肿大,生长发育障碍,体重不增,衰弱,腹泻,口腔念珠菌病,慢性湿疹性皮炎,发热等。其中常见的致病菌有肺炎球菌,流感杆菌,沙门菌,金黄色葡萄球菌和假单胞菌属,大肠杆菌等肺部表现慢性进行性肺间质病变,及淋巴细胞性间质性肺炎,或肺淋巴样是儿童艾滋病特异性的肺部表现。
儿童艾滋病病程较缓和,有咳嗽,呼吸困难,低氧血症,泌尿系统可表现出尿检异常主要为蛋白尿。常进展迅速,可发展成为肾功能衰竭,神经系统表现小头畸形,体格和智力发育迟缓,可出现局灶性异常,机会性感染儿童艾滋病并发机会性感染,包括病毒真菌和原虫感染较少,以卡氏肺囊虫病肺炎于首位,艾滋病病毒感染后,免疫系统损伤较成人严重,潜伏菌团出现症状,常病情进程快。